El Club Nàutic Sant Pere Pescador es troba al marge dret del riu Fluvià, aquest està situat dins la zona de predomini del Parc Natural dels Aiguamolls de l’Empordà i per tant compta amb un entorn privilegiat. L’entrada i sortida des de la bocana fins al port presenta un encant especial, ja que comporta un bell passeig pel riu, en les riberes del qual solen trobar-se pescadors. 

Al llarg de tot aquest recorregut es transcorre per paratges d’una singularitat ecològica i paisatgística extraordinàries. Indrets com Mig de dos rius, actualment propietat de la fundació Territori i Paisatge, la mal anomenada l’illa  Caramany o l’artificial illa  Caramany, reserva integral dels Aiguamolls de l’Empordà, en són un clar exemple. En aquestes zones hi podem trobar una rica i variada fauna i flora. La riba esquerra de l’illa és el sector navegable de la Reserva Integral, i esta ocupada per un bosc de ribera amb un bon estat ecològic.

El port fluvial esportiu fou construït pel Club Nàutic Sant Pere Pescador el 1974. Els anys setanta van ser una època en què el desenvolupament turístic ja era més que evident i per tant, equipaments d’aquestes característiques, destinats a l’oci i a l’esport nàutic, ja proliferaven arreu. Potser la seva singularitat es centra principalment en què es tracta d’un port fluvial a diferència de la resta que són marítims. Els promotors del projecte foren l’associació Club Nàutic Sant Pere Pescador i l’obra inicial constava d’un atracador per embarcacions esportives i de pesca i una escullera.

Actualment però, la principal finalitat d’aquest centre és la de promoure l’esport nàutic i fluvial, a més d’incloure serveis nàutics i un port d’amarratges. Disposa de 150 amarres, servei de rampa, grua i gasolinera per a les embarcacions. El Club Nàutic Sant Pere Pescador compta també amb un ampli pàrquing per a cotxes, bar i restaurant. Pels seus voltants es construí, posteriorment, una petita urbanització que porta el mateix nom